More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3002 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 763 aa  1549    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0337162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 732 aa  300  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.83 
 
 		 619 aa  279  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  45.23 
 
 		 882 aa  269  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 829 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.25 
 
 		 886 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.06 
 
 		 531 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  43.1 
 
 		 738 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.85 
 
 		 860 aa  257  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.64 
 
 		 886 aa  257  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1287 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1184 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 540 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.54 
 
 		 890 aa  247  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 810 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 841 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.06 
 
 		 1040 aa  243  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 		 997 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48 
 
 		 914 aa  242  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1184 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 		 871 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 		 997 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 1023 aa  240  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 1023 aa  238  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.7 
 
 		 893 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 846 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 869 aa  228  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 		 1193 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 869 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 882 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.07 
 
 		 1082 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 657 aa  217  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2451  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.26 
 
 		 802 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 		 655 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2451  putative diguanylate cyclase  40.43 
 
 		 651 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0018  histidine kinase  42.8 
 
 		 289 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 759 aa  200  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0017  histidine kinase  41.32 
 
 		 290 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 827 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 885 aa  194  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 870 aa  193  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.1 
 
 		 860 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.21 
 
 		 1038 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  31.95 
 
 		 1028 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 737 aa  184  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.3 
 
 		 1112 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1079 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 845 aa  180  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 522 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  40 
 
 		 525 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 953 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.56 
 
 		 932 aa  177  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 522 aa  177  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1021 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 962 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 845 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 758 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 649 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  37.99 
 
 		 630 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 774 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 750 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 766 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 770 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 650 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 642 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 1194 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 983 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1338 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 821 aa  171  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 1102 aa  171  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 973 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  33.68 
 
 		 527 aa  170  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.5 
 
 		 720 aa  170  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  35.06 
 
 		 1015 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 753 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.5 
 
 		 720 aa  170  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 819 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1113 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  31.92 
 
 		 821 aa  169  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2490  sensor histidine kinase  34.36 
 
 		 600 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 717 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 766 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 559 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1108 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  37.55 
 
 		 654 aa  168  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 798 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 954 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 670 aa  167  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1180 aa  167  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 766 aa  167  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 752 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  35.67 
 
 		 1561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 849 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 376 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 661 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 423 aa  165  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1018 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>