More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1352 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
732 aa  1505    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 
769 aa  392  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.13 
 
 
763 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0337162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
619 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.55 
 
 
763 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
2072 aa  249  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
608 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
1276 aa  240  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
1399 aa  238  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
1439 aa  234  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
653 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
619 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
862 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
1287 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
644 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  40.07 
 
 
1251 aa  211  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
931 aa  210  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
1325 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
1426 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
651 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
844 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2451  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.87 
 
 
802 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.312082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
968 aa  208  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
563 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
1032 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
1069 aa  205  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
569 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.04 
 
 
524 aa  203  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
1301 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
931 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
472 aa  200  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 
1082 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
753 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
841 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
968 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
768 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
783 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
440 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
493 aa  194  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
478 aa  193  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
771 aa  193  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
440 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
472 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
566 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 
593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
656 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
1121 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
638 aa  191  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
1758 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
639 aa  188  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
1078 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
1050 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
873 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
736 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
657 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
581 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
813 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
813 aa  184  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2451  putative diguanylate cyclase  37.05 
 
 
651 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
1225 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  29.96 
 
 
1028 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
901 aa  182  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
655 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
737 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
603 aa  180  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.48 
 
 
600 aa  180  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
935 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
596 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
366 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
559 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
1513 aa  177  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
530 aa  177  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
781 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
589 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
1111 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
603 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
727 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
544 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
765 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.95 
 
 
1038 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
1039 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
896 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
1055 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
500 aa  170  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
720 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
1253 aa  168  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
1039 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  39.48 
 
 
565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
963 aa  165  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  32.3 
 
 
821 aa  165  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1679  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.7 
 
 
1050 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  39.72 
 
 
213 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
890 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  39.39 
 
 
379 aa  162  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
433 aa  162  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  35.95 
 
 
630 aa  161  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
569 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>