More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0309 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.87 
 
 		 1032 aa  655    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 657 aa  1348    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.98 
 
 		 656 aa  868    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  71.52 
 
 		 783 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  69.18 
 
 		 812 aa  634  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 653 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.33 
 
 		 1050 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 		 906 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 		 544 aa  280  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 		 1225 aa  277  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 1325 aa  266  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 968 aa  253  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 1301 aa  253  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 404 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 563 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 596 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  37.23 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 813 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 651 aa  233  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.25 
 
 		 844 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 789 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 1439 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 1111 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 873 aa  228  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 608 aa  227  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 768 aa  226  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 771 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 581 aa  225  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 		 366 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  38.08 
 
 		 669 aa  223  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 781 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 1039 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 862 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 655 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 1069 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 901 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  47.14 
 
 		 379 aa  213  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 931 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 660 aa  210  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.9 
 
 		 569 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 842 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 1121 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  48.25 
 
 		 600 aa  207  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 813 aa  207  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 931 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 896 aa  207  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 559 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 589 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 638 aa  204  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 		 347 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  48.67 
 
 		 565 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 478 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 639 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 2072 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  47.16 
 
 		 524 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  49.77 
 
 		 350 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 736 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 439 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 493 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 1055 aa  197  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 603 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 500 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 1078 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 644 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 1425 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 727 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 1513 aa  194  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 766 aa  194  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 		 1265 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 737 aa  193  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  48.84 
 
 		 213 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 566 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1039 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 481 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 886 aa  190  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 841 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 619 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 1426 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 619 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  42.34 
 
 		 299 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 431 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 472 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 		 968 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 935 aa  187  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 732 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 593 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  43.91 
 
 		 288 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 1253 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 1276 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 896 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 763 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1758 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 372 aa  180  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>