More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2061 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
600 aa  1214    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 
559 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  37.84 
 
 
565 aa  220  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
968 aa  220  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 
1111 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
813 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
931 aa  213  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 
1050 aa  210  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  44.74 
 
 
379 aa  210  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 
651 aa  209  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 
896 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.52 
 
 
552 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 
589 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 
657 aa  207  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
581 aa  207  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 
781 aa  206  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
656 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 
366 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
789 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 
783 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
844 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 
737 aa  203  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
771 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
653 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
931 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  44.44 
 
 
288 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 
1039 aa  200  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
1121 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
901 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
347 aa  198  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
862 aa  198  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
472 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
873 aa  197  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
569 aa  196  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
968 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
974 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
1032 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
753 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.83 
 
 
524 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
1069 aa  193  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
841 aa  193  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
644 aa  193  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
608 aa  193  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 
1078 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
1439 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
1513 aa  191  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
431 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
765 aa  190  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
472 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
736 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
404 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
596 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
1325 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
655 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
1055 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
727 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
1039 aa  188  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
1225 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  45.54 
 
 
350 aa  188  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
768 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
439 aa  187  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
1758 aa  186  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
586 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
1426 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
619 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
1301 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
639 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
603 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
593 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
1425 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
732 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
763 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
935 aa  180  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
1276 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
372 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
886 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
1253 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
619 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
642 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
766 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
638 aa  174  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  41.12 
 
 
213 aa  174  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
566 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
603 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  36.89 
 
 
299 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
500 aa  171  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
678 aa  170  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
571 aa  170  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
510 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
769 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
440 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0325  histidine kinase  44.86 
 
 
185 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.28293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>