More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1070 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1426 aa  2921    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 1111 aa  338  5e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 1301 aa  297  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 1439 aa  291  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 862 aa  275  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 1032 aa  271  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 608 aa  270  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.65 
 
 		 653 aa  265  4.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.56 
 
 		 1325 aa  249  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.5 
 
 		 768 aa  246  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 524 aa  241  8e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 769 aa  231  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2677  hypothetical protein  53.05 
 
 		 208 aa  228  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 873 aa  227  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 1399 aa  221  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 563 aa  220  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 472 aa  215  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 1758 aa  215  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 1055 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  28.05 
 
 		 837 aa  214  9e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 644 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 813 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 844 aa  212  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 771 aa  212  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 1121 aa  211  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 766 aa  211  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 		 440 aa  211  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.22 
 
 		 1039 aa  210  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  30.09 
 
 		 637 aa  210  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 732 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 909 aa  209  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 736 aa  208  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 727 aa  208  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 651 aa  207  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 639 aa  205  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 619 aa  204  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 841 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 603 aa  202  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 593 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 783 aa  201  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  32.71 
 
 		 511 aa  201  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 1050 aa  201  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 1225 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 638 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 440 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 901 aa  199  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 968 aa  199  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 931 aa  198  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 1253 aa  198  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 2072 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 968 aa  197  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 603 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 813 aa  195  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 439 aa  195  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  26.32 
 
 		 849 aa  195  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 763 aa  195  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 765 aa  195  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 1425 aa  194  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 878 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 896 aa  193  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 478 aa  193  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 569 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 619 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 596 aa  192  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 655 aa  191  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 974 aa  191  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  46.05 
 
 		 365 aa  191  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 660 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 472 aa  191  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 753 aa  190  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 347 aa  190  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 593 aa  189  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 657 aa  188  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 559 aa  188  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 366 aa  188  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  43.61 
 
 		 524 aa  188  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 566 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 431 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 886 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  37.35 
 
 		 376 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 737 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 544 aa  184  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 1276 aa  184  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  45.13 
 
 		 288 aa  184  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.78 
 
 		 600 aa  183  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 656 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 789 aa  183  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 552 aa  182  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 581 aa  181  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  40.35 
 
 		 379 aa  181  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 1265 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  53.94 
 
 		 1113 aa  179  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 931 aa  179  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 589 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 720 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 1078 aa  179  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 1039 aa  178  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 980 aa  178  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 984 aa  178  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  39.92 
 
 		 350 aa  178  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>