More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0170 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
603 aa  1246    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
660 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  56.89 
 
 
637 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
1069 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
608 aa  345  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
644 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
603 aa  324  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
655 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
619 aa  300  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
530 aa  287  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
596 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
472 aa  283  9e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
844 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
862 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
1301 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
1253 aa  252  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
651 aa  248  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
813 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
935 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.47 
 
 
544 aa  237  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
1425 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
638 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
931 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
841 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
727 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
593 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
563 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
766 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
1032 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
2072 aa  225  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
873 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
1111 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
1050 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
896 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
901 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
968 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
639 aa  220  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
472 aa  220  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
781 aa  220  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
589 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
968 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
1039 aa  217  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
783 aa  216  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1325 aa  216  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
769 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
890 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
765 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
909 aa  213  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
771 aa  210  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
768 aa  210  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
1225 aa  209  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
1039 aa  210  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
478 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
931 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
736 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
1439 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
552 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
974 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
638 aa  203  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
1426 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
813 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
753 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
1758 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
737 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
789 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
720 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
656 aa  197  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
619 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
657 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
439 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
472 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
1121 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
763 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
653 aa  194  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
1078 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
1055 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
571 aa  190  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
1276 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
366 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
1245 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.92 
 
 
1466 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
347 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 
493 aa  182  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.93 
 
 
524 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
886 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
404 aa  180  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
569 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  31.02 
 
 
849 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
500 aa  179  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  29.2 
 
 
1265 aa  177  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
440 aa  177  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
732 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
433 aa  173  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  40.85 
 
 
565 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
593 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.92 
 
 
600 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  32.84 
 
 
401 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>