More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0459 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1301 aa  2654    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
1325 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 
1113 aa  423  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
1439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
1078 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
1039 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.14 
 
 
1225 aa  369  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
1039 aa  343  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
1253 aa  340  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
766 aa  332  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  56.34 
 
 
511 aa  318  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
768 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.03 
 
 
862 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
771 aa  301  8e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
1426 aa  297  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  50.92 
 
 
376 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
813 aa  288  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
1050 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
901 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
1032 aa  285  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
1177 aa  281  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
783 aa  280  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
968 aa  278  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
1758 aa  273  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
841 aa  268  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
844 aa  268  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
873 aa  263  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
651 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
1121 aa  260  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
931 aa  259  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
813 aa  258  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
608 aa  257  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
603 aa  254  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
657 aa  253  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
596 aa  253  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
1111 aa  249  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1309 aa  248  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
1425 aa  247  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
653 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
655 aa  245  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
765 aa  243  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
737 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
563 aa  242  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
581 aa  240  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
968 aa  239  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
736 aa  239  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
1513 aa  238  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  27.34 
 
 
1258 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
753 aa  234  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
781 aa  231  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
789 aa  230  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
656 aa  229  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
638 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
2072 aa  225  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
472 aa  224  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  30.81 
 
 
1265 aa  222  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
644 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
500 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
619 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
769 aa  218  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
603 aa  218  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
984 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
1069 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
493 aa  216  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
559 aa  215  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
1055 aa  215  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
366 aa  214  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
472 aa  213  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
569 aa  213  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
472 aa  212  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
886 aa  212  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
619 aa  211  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
431 aa  210  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
931 aa  209  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  40.53 
 
 
458 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.97 
 
 
1258 aa  209  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
404 aa  207  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
660 aa  207  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  41.29 
 
 
461 aa  207  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 
639 aa  204  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 
637 aa  204  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
732 aa  202  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
347 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
890 aa  202  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
638 aa  201  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
1262 aa  201  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
478 aa  201  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
980 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
720 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
842 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 
544 aa  197  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  43.48 
 
 
379 aa  197  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
935 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
1276 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  44.93 
 
 
350 aa  191  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
439 aa  191  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1399 aa  190  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  41.7 
 
 
299 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
763 aa  191  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
909 aa  190  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>