More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0079 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 909 aa  1868    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 1205 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 769 aa  232  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 768 aa  231  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 896 aa  231  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1289 aa  224  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 1246 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 1121 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 603 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 1134 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 		 637 aa  211  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1426 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 746 aa  208  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  31.61 
 
 		 479 aa  208  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 886 aa  206  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 660 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 608 aa  201  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 771 aa  201  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 1253 aa  200  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 1654 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 1078 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 603 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 991 aa  196  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 1439 aa  194  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 1111 aa  193  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 984 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  28.96 
 
 		 849 aa  190  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1301 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 765 aa  188  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 1390 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  48.04 
 
 		 400 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 		 511 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 2072 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 1714 aa  184  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 766 aa  181  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 1093 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 873 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 1093 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 788 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 1758 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 862 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  47.12 
 
 		 1265 aa  177  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  47.59 
 
 		 1113 aa  177  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  44.89 
 
 		 783 aa  177  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 783 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 2693 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 488 aa  172  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  35.14 
 
 		 770 aa  171  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 737 aa  170  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 572 aa  170  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 980 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 1560 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 732 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 		 1039 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 924 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  60.61 
 
 		 653 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  25.35 
 
 		 1248 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  40.97 
 
 		 744 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 526 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 964 aa  164  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 1399 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 681 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1222 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 945 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.11 
 
 		 530 aa  161  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 941 aa  161  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.48 
 
 		 728 aa  161  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 728 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 764 aa  160  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 892 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.46 
 
 		 763 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 1676 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 931 aa  159  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 593 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 347 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 439 aa  158  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.15 
 
 		 644 aa  158  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  29.61 
 
 		 837 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 945 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 547 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 767 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 524 aa  156  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 991 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 815 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 886 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1210 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 753 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 878 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 723 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 		 789 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1050 aa  155  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 901 aa  154  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 500 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1513 aa  154  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  46.93 
 
 		 268 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 720 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 3706 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 943 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 946 aa  152  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>