More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1353 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1078 aa  2217    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  36.49 
 
 
837 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
1301 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
1253 aa  352  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
1439 aa  335  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 
862 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  42.72 
 
 
511 aa  324  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  50.93 
 
 
1113 aa  302  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
768 aa  295  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  50.92 
 
 
376 aa  284  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.04 
 
 
766 aa  282  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
1039 aa  280  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
931 aa  275  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
472 aa  263  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
1111 aa  263  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 
813 aa  258  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
813 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 
519 aa  251  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
1050 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
1177 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
619 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
771 aa  234  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
736 aa  233  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.2 
 
 
523 aa  231  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
968 aa  230  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 
901 aa  228  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
841 aa  227  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
655 aa  226  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
638 aa  224  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
644 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
603 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  30.85 
 
 
1301 aa  221  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
789 aa  221  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
765 aa  220  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
1325 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  41.22 
 
 
458 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
608 aa  218  5e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
651 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
842 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
1425 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
968 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
2072 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
472 aa  214  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
727 aa  214  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
1069 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
1039 aa  208  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
596 aa  207  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  31.93 
 
 
852 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
931 aa  205  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
653 aa  204  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
1032 aa  204  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
769 aa  201  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
563 aa  200  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
935 aa  199  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
909 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  37.91 
 
 
461 aa  197  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
844 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
571 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
657 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.98 
 
 
1413 aa  195  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564112  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 
431 aa  195  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
478 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
873 aa  194  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
753 aa  194  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
1276 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
1055 aa  193  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
603 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
404 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
472 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
559 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
860 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.89 
 
 
600 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
875 aa  191  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
1513 aa  192  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
552 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
763 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
439 aa  191  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
347 aa  191  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
638 aa  191  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
581 aa  191  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  45.07 
 
 
213 aa  191  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
589 aa  190  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
781 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 
637 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
1121 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
732 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
544 aa  186  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
619 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
639 aa  184  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
720 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  45.87 
 
 
849 aa  184  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
660 aa  184  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
984 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
569 aa  182  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
656 aa  182  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
1399 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
1758 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
593 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
366 aa  181  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>