More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1055 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
639 aa  1319    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
862 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
844 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
644 aa  250  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
1225 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
1439 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
813 aa  234  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
603 aa  233  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
931 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 
563 aa  232  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
968 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 
783 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
1032 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
655 aa  228  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
619 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 
1301 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 
1426 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
608 aa  225  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
873 aa  225  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
478 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
768 aa  223  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
1069 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 
657 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
638 aa  221  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
737 aa  221  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 
968 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
653 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
472 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
931 aa  216  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
1121 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
651 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
1253 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
1325 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
656 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
813 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
1050 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
581 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
753 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
901 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
727 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
896 aa  211  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
472 aa  211  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
569 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
781 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
841 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
439 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
593 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
1039 aa  207  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
500 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
559 aa  206  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
732 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.09 
 
 
366 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
566 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 
596 aa  204  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.15 
 
 
524 aa  203  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.95 
 
 
600 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
771 aa  200  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
1078 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.62 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
472 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
736 aa  198  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
766 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
935 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  37.15 
 
 
565 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
1425 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
638 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
789 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
619 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
763 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 
493 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
431 aa  195  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
1513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
2072 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  32.8 
 
 
1265 aa  190  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
765 aa  190  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
660 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
372 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  45.54 
 
 
213 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
1039 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
1111 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
974 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  43.23 
 
 
379 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
886 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
347 aa  184  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
769 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
1399 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  43.38 
 
 
350 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
1055 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
433 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
678 aa  180  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
586 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
1276 aa  177  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
440 aa  177  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  44.74 
 
 
288 aa  177  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>