More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1919 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
862 aa  1768    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
813 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  39.79 
 
 
1265 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
896 aa  351  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.35 
 
 
768 aa  331  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.2 
 
 
1253 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.13 
 
 
1032 aa  330  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 
1078 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.99 
 
 
1439 aa  321  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.23 
 
 
766 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
653 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.03 
 
 
1301 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 
1039 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  52.61 
 
 
1113 aa  303  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 
608 aa  298  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
2072 aa  299  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
1325 aa  291  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  52.94 
 
 
511 aa  289  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  49.82 
 
 
376 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
844 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 
1426 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
563 aa  261  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1341 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
603 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1047 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
968 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  38.19 
 
 
945 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1047 aa  244  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
721 aa  243  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
813 aa  239  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
1255 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
639 aa  235  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 
1225 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
901 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
638 aa  229  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
472 aa  228  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
1758 aa  228  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
651 aa  227  8e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
1050 aa  227  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
763 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
931 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
841 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  36.65 
 
 
936 aa  221  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
783 aa  220  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
657 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
931 aa  219  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
765 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
1069 aa  219  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
732 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
581 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
1276 aa  214  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
789 aa  214  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 
472 aa  213  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
569 aa  213  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
753 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
644 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
478 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  38.73 
 
 
458 aa  212  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  55 
 
 
365 aa  211  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
619 aa  211  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
589 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
655 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
736 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
873 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
771 aa  207  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
1055 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
440 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
968 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 
559 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
510 aa  204  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
849 aa  204  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  45.37 
 
 
379 aa  204  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
769 aa  203  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.43 
 
 
1182 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
1425 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
619 aa  202  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 
440 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
500 aa  201  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
472 aa  201  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
1039 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 
1121 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.39 
 
 
600 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
431 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
781 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
886 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
737 aa  197  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
935 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  49.3 
 
 
213 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
571 aa  195  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 
566 aa  194  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
660 aa  194  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 
493 aa  194  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
638 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
439 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
720 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
593 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
404 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>