More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1354 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1276 aa  2647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
1399 aa  365  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 
1758 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
2072 aa  299  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
1055 aa  293  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
619 aa  271  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
968 aa  254  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
841 aa  248  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
769 aa  246  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  34.76 
 
 
479 aa  244  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
763 aa  240  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
732 aa  239  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
896 aa  234  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
1143 aa  232  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.25 
 
 
776 aa  229  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.781561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
1111 aa  229  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
765 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
1050 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
608 aa  218  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
862 aa  214  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
736 aa  213  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
651 aa  211  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
1439 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
1325 aa  209  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
655 aa  207  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
768 aa  206  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
844 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
1032 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
1121 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
931 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
737 aa  198  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
638 aa  196  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
842 aa  196  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
771 aa  195  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
653 aa  194  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
1078 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
589 aa  193  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
1301 aa  194  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
901 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
619 aa  192  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
1069 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
813 aa  191  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
472 aa  189  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
931 aa  188  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
727 aa  188  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
1253 aa  187  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
1425 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
720 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
781 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
603 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
638 aa  185  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 
477 aa  184  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
1426 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
974 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
559 aa  184  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
873 aa  184  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  29.59 
 
 
1265 aa  184  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
644 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
593 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  42.79 
 
 
787 aa  181  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
657 aa  181  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
552 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
1039 aa  181  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
783 aa  180  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.56 
 
 
600 aa  178  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
603 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
440 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
813 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
1225 aa  174  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
347 aa  173  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  39.04 
 
 
1251 aa  173  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
563 aa  173  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
886 aa  172  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
586 aa  172  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
440 aa  171  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
789 aa  170  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
660 aa  169  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
439 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
596 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
656 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
566 aa  169  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
431 aa  168  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
1513 aa  168  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
481 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
366 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  33.65 
 
 
559 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
935 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
472 aa  165  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  38.3 
 
 
565 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
544 aa  163  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.3 
 
 
524 aa  163  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
569 aa  163  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
1039 aa  163  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  38.89 
 
 
213 aa  162  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  36.79 
 
 
288 aa  161  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0053  putative PAS/PAC sensor protein  42.7 
 
 
422 aa  160  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
478 aa  159  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
639 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
642 aa  157  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
404 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>