More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1440 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 477 aa  987    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 768 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 1276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  36.95 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  30.35 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 1078 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  36.8 
 
 		 1113 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 766 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 608 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 1301 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 1439 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 1039 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  34.31 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 813 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 1253 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  34.6 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 862 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 		 849 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 901 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 896 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 873 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 769 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 1121 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1134 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 660 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  28.37 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 1425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  42.38 
 
 		 200 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 789 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 909 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 1426 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 771 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 980 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 653 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 1055 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 931 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 644 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  41.14 
 
 		 1265 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 984 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 753 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 1399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 1111 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 		 837 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1019 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  45.83 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1184 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 596 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 		 630 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 886 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  31.13 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  40.3 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  36.75 
 
 		 637 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  47.79 
 
 		 186 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  28.62 
 
 		 770 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  40.61 
 
 		 268 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 1758 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.85 
 
 		 843 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 1325 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 1513 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 1390 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 619 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 759 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 1055 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.99 
 
 		 1338 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 737 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 781 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  34.35 
 
 		 906 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 1309 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 1039 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  48.96 
 
 		 196 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  33.82 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 530 aa  101  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 1509 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 1559 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  38.52 
 
 		 400 aa  99.8  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 347 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3445  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.75 
 
 		 1094 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 827 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 921 aa  98.2  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 2072 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 765 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 472 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  36.72 
 
 		 559 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 1676 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 656 aa  97.1  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  38.41 
 
 		 669 aa  97.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  37.23 
 
 		 287 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 878 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.68 
 
 		 804 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 550 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>