More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1244 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
813 aa  1679    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
1253 aa  313  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
873 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
768 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 
644 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
2072 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
1039 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
655 aa  272  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
841 aa  271  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1055 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
931 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
608 aa  267  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
931 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
651 aa  259  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
1301 aa  259  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
1111 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1078 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
789 aa  253  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
472 aa  253  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
890 aa  252  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
968 aa  250  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
896 aa  248  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
771 aa  248  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
603 aa  247  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
1069 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
472 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
765 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
844 aa  244  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
1325 aa  244  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
1050 aa  243  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
1425 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
404 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
753 aa  240  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
862 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
657 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
589 aa  239  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
736 aa  239  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
559 aa  237  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
656 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
619 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
1121 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
500 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 
901 aa  235  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
1032 aa  235  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
781 aa  233  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
813 aa  233  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
638 aa  231  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
968 aa  231  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
603 aa  231  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 
783 aa  230  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
493 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
737 aa  225  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
581 aa  226  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
472 aa  223  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
1225 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
660 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
478 aa  218  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
727 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
653 aa  217  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  47.01 
 
 
600 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 
586 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
639 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  47.42 
 
 
213 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
638 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
431 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
439 aa  212  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
596 aa  211  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
678 aa  207  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
769 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
481 aa  206  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
766 aa  205  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 
1439 aa  204  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
1039 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
763 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  44.81 
 
 
288 aa  201  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
729 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
552 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.8 
 
 
524 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
935 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
366 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
569 aa  197  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  46.36 
 
 
350 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  43.97 
 
 
379 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
1426 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.25 
 
 
347 aa  194  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
974 aa  193  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  36.83 
 
 
565 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 
544 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  26.29 
 
 
1265 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
1513 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
720 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
1276 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
569 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
732 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  42.04 
 
 
299 aa  185  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
642 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
372 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0999  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
455 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0658985  normal  0.43266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>