More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1525 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
813 aa  1667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
862 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
1301 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  51.15 
 
 
511 aa  271  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  47.89 
 
 
376 aa  269  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 
1439 aa  267  5e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 
768 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  31.49 
 
 
1113 aa  260  9e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 
1078 aa  258  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.18 
 
 
766 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
1039 aa  250  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
1253 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
844 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
655 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
472 aa  233  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
813 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1322 aa  229  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
581 aa  228  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
653 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
901 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
736 aa  224  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 
1279 aa  224  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
968 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
1069 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
478 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
608 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
727 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
1225 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
1032 aa  217  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
968 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 
1265 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 
544 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
571 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
1426 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
841 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
931 aa  211  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
472 aa  211  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
2072 aa  210  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
1325 aa  210  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
559 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
1039 aa  208  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
657 aa  207  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  38.91 
 
 
458 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
765 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
563 aa  205  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
472 aa  205  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
619 aa  205  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
651 aa  205  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
753 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 
569 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
771 aa  204  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
638 aa  204  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
656 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
783 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  39.39 
 
 
461 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
347 aa  201  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
619 aa  200  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
1425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.41 
 
 
600 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
500 aa  198  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
431 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  35.71 
 
 
565 aa  197  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
1050 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
530 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
493 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
404 aa  195  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
873 aa  194  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
639 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
1758 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  42.36 
 
 
299 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
439 aa  190  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
758 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
789 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
593 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0818  EAL and GGDEF domain-containing protein  41.13 
 
 
976 aa  188  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
596 aa  187  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
1121 aa  187  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
737 aa  187  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.91 
 
 
1239 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
896 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.86 
 
 
524 aa  185  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1079 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
732 aa  184  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
589 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
931 aa  183  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
644 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
586 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
660 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
566 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
1055 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
440 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
1111 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
603 aa  180  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
729 aa  180  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
935 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
366 aa  179  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
974 aa  178  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
781 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
440 aa  177  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>