More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0545 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
896 aa  1849    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
886 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 
849 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
873 aa  356  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
862 aa  351  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
901 aa  324  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 
589 aa  303  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
968 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
841 aa  266  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
768 aa  257  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
1032 aa  251  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
844 aa  249  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
813 aa  238  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  32.92 
 
 
1113 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
737 aa  235  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
1276 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
968 aa  233  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
771 aa  231  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
909 aa  231  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
1111 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
789 aa  225  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
1325 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
603 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
1439 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
769 aa  221  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
974 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
660 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
651 aa  218  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
935 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
348 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.927247  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
766 aa  213  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
984 aa  211  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
1039 aa  211  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.92 
 
 
600 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
1253 aa  209  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
608 aa  204  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
753 aa  204  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
1121 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
931 aa  201  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
1758 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
472 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
439 aa  195  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
1069 aa  195  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
639 aa  194  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  46.95 
 
 
350 aa  194  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
1426 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  27.17 
 
 
1265 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
736 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
656 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
619 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  43.83 
 
 
565 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 
637 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
1055 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
638 aa  191  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
347 aa  191  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
559 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
478 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
655 aa  189  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
552 aa  188  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
644 aa  189  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
931 aa  188  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
727 aa  188  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
783 aa  187  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  45.89 
 
 
299 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
813 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
807 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
581 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
781 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 
511 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
657 aa  181  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
596 aa  180  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
569 aa  180  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
1301 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
1078 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
472 aa  177  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.73 
 
 
524 aa  177  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
1225 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
500 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
563 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
1050 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
2072 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
642 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  42.31 
 
 
288 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  39.75 
 
 
379 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
603 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
493 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
530 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
593 aa  173  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
619 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
890 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
732 aa  171  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.67 
 
 
653 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
1425 aa  171  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
366 aa  171  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
638 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
431 aa  170  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0236  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 
468 aa  169  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
593 aa  169  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
586 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>