More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0872 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
500 aa  1021    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
472 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
550 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
472 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
1425 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
813 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
1050 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
931 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
1301 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
656 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
873 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
651 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
736 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
783 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
655 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
789 aa  210  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
581 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
608 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
931 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
968 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
644 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
1225 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
544 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
844 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
366 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
653 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
638 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
862 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
472 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
841 aa  199  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 
753 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
1055 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
589 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
1039 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
813 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
478 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  41.5 
 
 
402 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.59 
 
 
524 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
657 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
781 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
1032 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
596 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
1039 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
1111 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  44.74 
 
 
350 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
768 aa  193  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
372 aa  193  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
638 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
901 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
737 aa  189  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
968 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 
1069 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
603 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.91 
 
 
727 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
493 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
619 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  45.71 
 
 
213 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
639 aa  186  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
431 aa  186  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
1121 aa  186  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
1513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 
1325 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
1439 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  40.7 
 
 
637 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
720 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 
563 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
481 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  34.94 
 
 
565 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  38.83 
 
 
849 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
603 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
1078 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
660 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
771 aa  177  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
769 aa  176  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
586 aa  176  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
896 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
566 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
1426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
763 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  40.42 
 
 
288 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
886 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
678 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
510 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.6 
 
 
600 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  41.7 
 
 
1265 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  40.83 
 
 
400 aa  170  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
732 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
404 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  42.71 
 
 
511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  42.38 
 
 
299 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  43.04 
 
 
379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>