More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1360 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 524 aa  1069    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 631 aa  326  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 1426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 593 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37 
 
 		 744 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 603 aa  186  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 681 aa  186  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 572 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 1246 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  46.11 
 
 		 1113 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 789 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 771 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  44.39 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  37.31 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 873 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 1301 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 1078 aa  176  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 3706 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 1654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 1513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  40.29 
 
 		 511 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 1093 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 886 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 769 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  37.91 
 
 		 783 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 1093 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  39.54 
 
 		 1265 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 878 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  46.2 
 
 		 400 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  45.5 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 886 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 788 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 1676 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1177 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 766 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 660 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 1439 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 932 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 651 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 931 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.43 
 
 		 1239 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.09 
 
 		 771 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  37.45 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 1253 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 608 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 872 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  39.31 
 
 		 837 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  36.82 
 
 		 376 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 768 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 1039 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 862 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.5 
 
 		 653 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 1253 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 991 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 1047 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.72 
 
 		 1111 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 1325 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 382 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  61.29 
 
 		 186 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 896 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 909 aa  156  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 1390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.52 
 
 		 753 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1182 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  54.14 
 
 		 669 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 815 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 913 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.25 
 
 		 1663 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 945 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 912 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 819 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1227 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 		 644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  32.6 
 
 		 1248 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  50.32 
 
 		 849 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.73 
 
 		 754 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2267  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 576 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0262742  normal  0.128517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 215 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 941 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 839 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  42.08 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  48.77 
 
 		 200 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 545 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.76 
 
 		 1668 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  44.38 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 746 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 901 aa  144  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1210 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 704 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>