More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3538 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1546    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  48.23 
 
 		 918 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  48.19 
 
 		 1182 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  54.07 
 
 		 657 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  46.2 
 
 		 704 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  40.77 
 
 		 1289 aa  342  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  40.35 
 
 		 1248 aa  312  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 945 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1210 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 819 aa  292  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  36.35 
 
 		 676 aa  287  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  53.06 
 
 		 886 aa  280  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 746 aa  276  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  49.06 
 
 		 1047 aa  273  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 892 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 1676 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  54.55 
 
 		 800 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3536  putative sensory transduction histidine kinase  85.51 
 
 		 161 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0560358  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  44.34 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 547 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.95 
 
 		 783 aa  246  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 682 aa  243  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 936 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 834 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 1093 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 1093 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 727 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.93 
 
 		 744 aa  214  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 991 aa  211  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 1019 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1714 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 964 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 1051 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 1654 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 1239 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 932 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 945 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 788 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 771 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 613 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 815 aa  184  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 1390 aa  184  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 3706 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 681 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 526 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 1253 aa  180  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 1177 aa  180  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 767 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 1246 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 912 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 723 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 839 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 980 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 913 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 347 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.33 
 
 		 1668 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 732 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.96 
 
 		 1021 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.24 
 
 		 1663 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 215 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.44 
 
 		 1143 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 631 aa  157  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.44 
 
 		 1143 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 1051 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 878 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 1560 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 941 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 382 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 439 aa  151  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 1183 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 472 aa  151  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 674 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 813 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 872 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.65 
 
 		 696 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0252232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 524 aa  147  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  34.37 
 
 		 914 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28 
 
 		 862 aa  145  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 746 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 1093 aa  144  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 532 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 732 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  38.81 
 
 		 624 aa  142  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 790 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 739 aa  141  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 782 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 693 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  36.64 
 
 		 650 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 2693 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 747 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 1227 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 657 aa  138  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>