More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0429 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  99.82 
 
 
1093 aa  2250    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1093 aa  2253    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
1676 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
1654 aa  314  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.35 
 
 
783 aa  281  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.8 
 
 
1248 aa  277  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  26.62 
 
 
886 aa  274  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.19 
 
 
1182 aa  264  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
3706 aa  264  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
1741 aa  264  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
1138 aa  264  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
1390 aa  263  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
1253 aa  258  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  29.57 
 
 
819 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  40.58 
 
 
744 aa  254  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
2693 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.41 
 
 
945 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.26 
 
 
1210 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
932 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
1714 aa  243  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
681 aa  238  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
913 aa  239  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
980 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.52 
 
 
754 aa  232  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
613 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
964 aa  231  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
551 aa  230  9e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
1246 aa  230  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
771 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
912 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
488 aa  224  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
1051 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
1051 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.75 
 
 
1239 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
815 aa  217  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
834 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
788 aa  212  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
1177 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  29.38 
 
 
918 aa  207  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 
1205 aa  207  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
572 aa  204  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
547 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
764 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 
439 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
945 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 
1267 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  26.86 
 
 
892 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
872 aa  198  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
727 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
526 aa  196  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
1418 aa  195  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
767 aa  195  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  29.02 
 
 
936 aa  193  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
1560 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
839 aa  192  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1927 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
1183 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
991 aa  190  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.95 
 
 
746 aa  189  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.18 
 
 
676 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
1227 aa  188  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  33.16 
 
 
704 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  26.13 
 
 
1047 aa  186  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.95 
 
 
682 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  32.93 
 
 
492 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.04 
 
 
688 aa  185  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.03 
 
 
1143 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.33 
 
 
449 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.03 
 
 
1143 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
479 aa  180  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
924 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
909 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 
723 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
941 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.09 
 
 
1791 aa  179  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
732 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.68 
 
 
1428 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.77 
 
 
657 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
347 aa  176  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
790 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
585 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
674 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
215 aa  173  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
524 aa  172  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.28 
 
 
1668 aa  172  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.78 
 
 
1663 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  44 
 
 
856 aa  171  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
631 aa  170  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  38.37 
 
 
800 aa  167  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
739 aa  164  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
878 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
472 aa  164  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.28 
 
 
1959 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  38.46 
 
 
1289 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
657 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  51.53 
 
 
1629 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0662  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 
918 aa  162  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0359693 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
461 aa  162  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
912 aa  160  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
841 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>