More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3009 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1590    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.4 
 
 		 744 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 892 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 		 834 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1093 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1093 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 1654 aa  273  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.24 
 
 		 1248 aa  271  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 		 488 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 727 aa  261  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 945 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 815 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 1676 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 572 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.95 
 
 		 754 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1210 aa  244  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 771 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 681 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 1390 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 1714 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 964 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.4 
 
 		 676 aa  220  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 746 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 819 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 1253 aa  219  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 1051 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  39.95 
 
 		 1239 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.4 
 
 		 918 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 547 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 932 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 3706 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 682 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  34 
 
 		 1182 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 1177 aa  210  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 991 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 526 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 1246 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 913 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 788 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 945 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 886 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 704 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 1047 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 812 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.86 
 
 		 449 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 1051 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 912 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 439 aa  194  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 872 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 839 aa  191  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  37.5 
 
 		 657 aa  191  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 936 aa  190  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 1560 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 723 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 347 aa  188  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 1227 aa  187  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 980 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 767 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 941 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 732 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 613 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 472 aa  180  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  44.07 
 
 		 800 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  45.67 
 
 		 1668 aa  180  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 462 aa  178  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 		 909 aa  177  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  45.67 
 
 		 1663 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 2693 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 215 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 878 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  40.5 
 
 		 1289 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 524 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 771 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 585 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 674 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.55 
 
 		 802 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 1183 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 619 aa  164  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 924 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.45 
 
 		 1021 aa  160  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 752 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 749 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 782 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.49 
 
 		 1611 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 856 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 832 aa  157  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 737 aa  157  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.36 
 
 		 1578 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 		 578 aa  156  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 813 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 1255 aa  155  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  26.46 
 
 		 917 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1260 aa  153  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 631 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>