More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1972 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 815 aa  1672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  49.69 
 
 		 1239 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 1246 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.67 
 
 		 783 aa  267  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 		 1654 aa  256  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 771 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 1390 aa  248  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 964 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 991 aa  233  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.67 
 
 		 744 aa  232  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 1093 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 1093 aa  227  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 572 aa  223  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 681 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 945 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 886 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 3706 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 660 aa  217  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 913 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.29 
 
 		 1248 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 839 aa  211  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 788 aa  210  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1177 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 1714 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 1676 aa  207  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 526 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 767 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 551 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 945 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 682 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 872 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 932 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 439 aa  198  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 1051 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 764 aa  193  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1253 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 1227 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 613 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1210 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 834 aa  191  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1182 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 892 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 1051 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.58 
 
 		 754 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 382 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 912 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 1560 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 878 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 		 215 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 704 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 790 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 		 732 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 674 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 727 aa  180  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 1183 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 941 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.52 
 
 		 449 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 723 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  32.26 
 
 		 918 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.65 
 
 		 676 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 1047 aa  173  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 657 aa  173  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 347 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.44 
 
 		 1663 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.93 
 
 		 1668 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 2693 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 980 aa  171  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 462 aa  171  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 819 aa  168  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 746 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.47 
 
 		 1021 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 752 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 492 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 619 aa  163  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  35.36 
 
 		 657 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 782 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 771 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 909 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  40.54 
 
 		 800 aa  157  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 924 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 532 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 856 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 832 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 698 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 631 aa  151  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 1019 aa  151  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 813 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 585 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 936 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1289 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 1093 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 479 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 603 aa  146  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.25 
 
 		 1260 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>