More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3899 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 613 aa  1257    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 		 3706 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 1676 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 767 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 2693 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1093 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1093 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  51.15 
 
 		 945 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 1654 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 547 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 		 732 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.86 
 
 		 1248 aa  217  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 1177 aa  217  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1182 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 		 1560 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 771 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 1714 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 945 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 1390 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 439 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 1253 aa  191  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 964 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 1239 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  46.82 
 
 		 744 aa  190  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 572 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 839 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 704 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.96 
 
 		 754 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 526 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 815 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  44.8 
 
 		 783 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.83 
 
 		 918 aa  180  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 746 aa  180  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 980 aa  180  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 941 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 1246 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 991 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 912 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  28.9 
 
 		 676 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1210 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 878 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 551 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 886 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 834 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  36.99 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 681 aa  170  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 932 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 913 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 788 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 215 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 764 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 674 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 1047 aa  163  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 1051 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 682 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 1183 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 924 aa  161  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 382 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 1227 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.42 
 
 		 1668 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  31.54 
 
 		 800 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 892 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  38.49 
 
 		 1289 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 819 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 872 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 771 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.46 
 
 		 1663 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 936 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 790 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 1051 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 347 aa  150  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 462 aa  150  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.8 
 
 		 1081 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 492 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 585 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 727 aa  146  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 479 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  35.43 
 
 		 657 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 723 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 532 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 657 aa  143  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 856 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 631 aa  143  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 732 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 782 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 739 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 461 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 909 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 362 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 524 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 362 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 361 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 437 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 746 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>