More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4563 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
771 aa  1577    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
1654 aa  257  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
1676 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.65 
 
 
783 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1390 aa  253  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  32.11 
 
 
1182 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
1714 aa  250  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
964 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
815 aa  243  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
767 aa  240  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33 
 
 
1239 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
1093 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.09 
 
 
1210 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
1093 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
1253 aa  232  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
613 aa  227  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
681 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
3706 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.02 
 
 
945 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
932 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
1246 aa  217  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
572 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
1177 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  40.26 
 
 
744 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
547 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 
1560 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.94 
 
 
1248 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
909 aa  207  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
732 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  53.24 
 
 
723 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.57 
 
 
704 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  26.81 
 
 
892 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
834 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
945 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30 
 
 
913 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  37.22 
 
 
682 aa  201  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
439 aa  201  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
912 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.87 
 
 
754 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.19 
 
 
918 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  47.91 
 
 
941 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
980 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
1051 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  28.3 
 
 
746 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
991 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
551 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
790 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
479 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  33.89 
 
 
886 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
1267 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  48.02 
 
 
2693 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
524 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
1183 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27 
 
 
819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
1060 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  36.81 
 
 
449 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
1051 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  34.08 
 
 
657 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
382 aa  183  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1047 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
788 aa  181  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
526 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
215 aa  180  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  34.99 
 
 
492 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.1 
 
 
1663 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
839 aa  177  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.61 
 
 
1668 aa  177  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
674 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
752 aa  173  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
782 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
872 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1977 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
545 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
764 aa  171  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
347 aa  170  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
878 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
727 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  29.07 
 
 
936 aa  168  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
1516 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1363 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  42.02 
 
 
1289 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  29.35 
 
 
800 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
462 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
813 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.2 
 
 
676 aa  161  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
657 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
904 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
1093 aa  156  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
771 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
757 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
1741 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
382 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
832 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
749 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
933 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
585 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
856 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>