More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4852 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 		 752 aa  775    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 746 aa  1533    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 698 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 774 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 757 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 747 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 749 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 739 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 782 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 732 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 856 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 771 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 437 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 813 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 832 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 807 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 756 aa  190  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 272 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  41.44 
 
 		 783 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 771 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 693 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 815 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 732 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 1177 aa  164  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 572 aa  163  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 1654 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  39.82 
 
 		 744 aa  160  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1560 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 439 aa  158  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 648 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.4 
 
 		 1668 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.4 
 
 		 1663 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 964 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 488 aa  156  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1182 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 1390 aa  154  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 2693 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 681 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 991 aa  151  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 547 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 1714 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 382 aa  147  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 878 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 945 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  41.12 
 
 		 1248 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 767 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 347 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 551 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 526 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  36.82 
 
 		 754 aa  144  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  40.81 
 
 		 1289 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 1253 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 215 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 788 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 1246 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 1676 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 1093 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 1093 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 980 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 3706 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 941 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  35.83 
 
 		 918 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1210 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  34 
 
 		 682 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 834 aa  138  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 1227 aa  138  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 1093 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  38.06 
 
 		 800 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  31.11 
 
 		 624 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 704 aa  137  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 886 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 1047 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 472 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 524 aa  134  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 613 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  35.2 
 
 		 657 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 1183 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 1239 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 362 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  36.11 
 
 		 449 aa  131  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  35.85 
 
 		 676 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 631 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 909 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  29.28 
 
 		 650 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 361 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 362 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 416 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1051 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 932 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 462 aa  125  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 1205 aa  125  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 945 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 603 aa  124  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 892 aa  124  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>