More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2255 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
648 aa  1347    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
693 aa  300  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
782 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  35.51 
 
 
624 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
1093 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
774 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
813 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
752 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
1714 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
856 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
746 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
964 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
807 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
532 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
698 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  38 
 
 
681 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  38.21 
 
 
1248 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
1253 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
1654 aa  140  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
347 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
572 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
739 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  35.65 
 
 
449 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
941 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  36.32 
 
 
1210 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
437 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
991 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
1093 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
1093 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  35.24 
 
 
1182 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  41.21 
 
 
918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  35.96 
 
 
754 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.65 
 
 
783 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
771 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
439 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
815 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
747 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
382 aa  130  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
771 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  37.5 
 
 
945 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  34.76 
 
 
676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  36.07 
 
 
1047 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.94 
 
 
704 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  36.49 
 
 
886 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
932 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
834 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  34.11 
 
 
892 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
909 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
674 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
1177 aa  126  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  35.68 
 
 
657 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
832 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
1560 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  36.32 
 
 
800 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.71 
 
 
1239 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
2693 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  36.28 
 
 
819 aa  124  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  33.18 
 
 
682 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  36.04 
 
 
1289 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  33.49 
 
 
746 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  37.16 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
488 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
1390 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
1051 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
462 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
732 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  36.2 
 
 
936 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
547 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
872 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
788 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
723 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
913 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
945 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35 
 
 
603 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
764 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
354 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
472 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
1051 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
878 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
358 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
1676 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.37 
 
 
744 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
272 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.67 
 
 
1668 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
3706 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
1183 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  34.6 
 
 
492 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
348 aa  114  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.25 
 
 
348 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
1246 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
613 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
980 aa  113  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>