More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5851 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 437 aa  903    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 757 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 698 aa  335  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 		 774 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 746 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 782 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 752 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 747 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 739 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 856 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 813 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 732 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 749 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 771 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 832 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 807 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 272 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 756 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 572 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 1654 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 681 aa  152  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 945 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  39.42 
 
 		 783 aa  149  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 964 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 771 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 2693 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 1560 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 1676 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 767 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 3706 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1210 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.4 
 
 		 1668 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.96 
 
 		 1663 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 980 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 648 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 547 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  39.13 
 
 		 744 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 839 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 1093 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 551 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 1047 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 1093 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  29.44 
 
 		 624 aa  136  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 732 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1714 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 613 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  36.45 
 
 		 918 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1182 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 941 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 878 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.09 
 
 		 754 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 1246 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 472 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  35.48 
 
 		 800 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 488 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 1253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 815 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 1390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  36.1 
 
 		 1248 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 913 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 788 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  33.49 
 
 		 676 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 991 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 1093 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.27 
 
 		 1239 aa  126  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1289 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 693 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 723 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 704 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 886 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.89 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 657 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  29.17 
 
 		 650 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 834 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 1177 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 603 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 872 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 1183 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 945 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 1051 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 932 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 524 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>