More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3460 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 813 aa  1678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 807 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 832 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 782 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 739 aa  283  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 749 aa  280  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 746 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 752 aa  264  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 774 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 747 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 732 aa  247  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 856 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 756 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 698 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 757 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 437 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 1714 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 272 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 572 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 771 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 1093 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 1390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 1093 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  41.9 
 
 		 783 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 1654 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 488 aa  151  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 648 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 815 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  35.4 
 
 		 754 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 964 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 1239 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 878 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  36.68 
 
 		 918 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 681 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 991 aa  142  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 526 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 1253 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 834 aa  140  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 945 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  36.26 
 
 		 1248 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 980 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 693 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1182 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 682 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 382 aa  138  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 1047 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 941 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 764 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 1560 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 723 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 886 aa  137  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.36 
 
 		 744 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.44 
 
 		 1663 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 439 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  36.57 
 
 		 449 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 492 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  35.27 
 
 		 1289 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 462 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.89 
 
 		 1668 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 788 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 1676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 347 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  33.47 
 
 		 800 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1210 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  32.81 
 
 		 624 aa  131  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 215 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1246 aa  130  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  34.15 
 
 		 657 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 704 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 945 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 524 aa  128  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 1093 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 2693 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 819 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 1205 aa  127  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 631 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 727 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  37.33 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 767 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 892 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 872 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 472 aa  124  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 732 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 657 aa  124  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 746 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 547 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 382 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 913 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 909 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 1051 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 1051 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1177 aa  121  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  34.74 
 
 		 676 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 3706 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 839 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  34.88 
 
 		 650 aa  118  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 1183 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>