More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2687 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
215 aa  436  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
1654 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  42.79 
 
 
744 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 
815 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
991 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 
488 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
964 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 
3706 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
347 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
771 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
941 aa  177  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  42.33 
 
 
783 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 
732 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
1093 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  42.99 
 
 
1239 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
1093 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
1714 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
1253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
572 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
526 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
727 aa  170  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  38.91 
 
 
682 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
681 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
657 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
764 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
613 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
1390 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
1177 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
1560 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
945 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  40.85 
 
 
657 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
547 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
2693 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
1051 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
767 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  38.29 
 
 
754 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
834 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
1676 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
439 aa  157  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  38.67 
 
 
1182 aa  157  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  40 
 
 
1248 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  36.36 
 
 
892 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
839 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  38.66 
 
 
1210 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  37.84 
 
 
918 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  37.02 
 
 
819 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.44 
 
 
704 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
674 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
382 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
932 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  38.01 
 
 
945 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
551 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.19 
 
 
1663 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
462 aa  148  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.67 
 
 
1668 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
524 aa  148  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
1246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  34.86 
 
 
449 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  37.85 
 
 
1289 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  38.5 
 
 
746 aa  145  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  36 
 
 
1183 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
872 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
788 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  36.32 
 
 
800 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  37.77 
 
 
886 aa  144  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
980 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
532 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
723 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
746 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
878 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  37.38 
 
 
624 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
603 aa  141  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
631 aa  141  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
790 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
472 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
382 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  38.68 
 
 
650 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
1227 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
585 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
1093 aa  138  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
771 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  35.34 
 
 
492 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  35.93 
 
 
1047 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
732 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  34.85 
 
 
936 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
782 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  36.19 
 
 
676 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
739 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
856 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
924 aa  134  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
912 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
909 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
913 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
813 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
756 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
752 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
479 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
381 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
406 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  37 
 
 
832 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>