More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0116 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
698 aa  1436    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 
757 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
746 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
752 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
782 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
437 aa  323  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
739 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 
832 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
771 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
732 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
747 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
856 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
749 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
813 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
807 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
756 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
272 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
964 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
815 aa  152  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
1654 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
1093 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
1093 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
771 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
439 aa  145  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
648 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.27 
 
 
783 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
681 aa  144  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
991 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
1390 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
1253 aa  140  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
3706 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
1093 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
1560 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
764 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.9 
 
 
1668 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
941 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
834 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
526 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
839 aa  134  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
572 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
693 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
788 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
674 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  34.42 
 
 
918 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.12 
 
 
744 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.95 
 
 
1663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
1676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
945 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.97 
 
 
682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
932 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
767 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
1714 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
613 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
1177 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
2693 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  36.32 
 
 
754 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
790 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
551 aa  125  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.19 
 
 
704 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.63 
 
 
1210 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
532 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
980 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
1183 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
472 aa  124  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
347 aa  124  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  33.48 
 
 
1289 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.82 
 
 
1239 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
1246 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
723 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
732 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.98 
 
 
1182 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
913 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
416 aa  120  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  32.56 
 
 
449 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
878 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
215 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
924 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
872 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.3 
 
 
1248 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  32.24 
 
 
1047 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
462 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  30.94 
 
 
650 aa  117  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  27.51 
 
 
624 aa  117  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  34.45 
 
 
886 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
1051 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
406 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  31.28 
 
 
945 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
382 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
912 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
909 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
1051 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34 
 
 
382 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
1227 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>