More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2935 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 892 aa  1827    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  47.5 
 
 		 1210 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  46.71 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 819 aa  445  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 746 aa  363  8e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.7 
 
 		 783 aa  344  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 682 aa  335  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  41.4 
 
 		 449 aa  297  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1182 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 754 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  35.14 
 
 		 1248 aa  253  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 936 aa  252  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 945 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  33.14 
 
 		 918 aa  237  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 834 aa  231  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 886 aa  231  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  33.54 
 
 		 676 aa  230  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 727 aa  230  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 1047 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 572 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  39.34 
 
 		 657 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 1246 aa  220  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 1676 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 3706 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 991 aa  213  9e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 1654 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  35.94 
 
 		 800 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  26.69 
 
 		 744 aa  206  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 932 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1289 aa  200  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 1093 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 1093 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 767 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 964 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 462 aa  195  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 1177 aa  194  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 1714 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 1253 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 551 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 488 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 771 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 1390 aa  188  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 1239 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 547 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 980 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 2693 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 631 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 		 941 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 913 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 681 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 815 aa  174  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 1051 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 1051 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 945 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 839 aa  160  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 909 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 613 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 526 aa  158  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 912 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 639 aa  157  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 215 aa  157  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 1560 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 764 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 439 aa  150  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 382 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 1183 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 788 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 872 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 347 aa  147  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 732 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.24 
 
 		 1668 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.55 
 
 		 1663 aa  144  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 479 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 524 aa  141  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 878 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 674 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 1138 aa  137  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 782 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 657 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 472 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 674 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 461 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  24.44 
 
 		 872 aa  131  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 693 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 648 aa  128  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1019 aa  127  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1093 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 1227 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 771 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  36.62 
 
 		 650 aa  125  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.17 
 
 		 1423 aa  125  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 813 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.7 
 
 		 1021 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 746 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 585 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 774 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>