More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2362 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  917    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  51 
 
 		 682 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 892 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  43 
 
 		 819 aa  296  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  44.32 
 
 		 1210 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1182 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 704 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  44.34 
 
 		 754 aa  249  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  47.18 
 
 		 657 aa  249  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  45.45 
 
 		 1248 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 886 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  43.56 
 
 		 918 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  45.4 
 
 		 676 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 834 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 945 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 936 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  48.41 
 
 		 746 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 1047 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 727 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  47.58 
 
 		 1289 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  49.79 
 
 		 800 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 572 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 991 aa  202  9e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.86 
 
 		 783 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 488 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 964 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 1676 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 1654 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 932 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 1714 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1093 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 945 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 1093 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 771 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 1253 aa  179  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.23 
 
 		 744 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 551 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 815 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 613 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 547 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 723 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 3706 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 1246 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 767 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 788 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 732 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 1239 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 1560 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 1390 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.44 
 
 		 1668 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.44 
 
 		 1663 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 839 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1177 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 941 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 980 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 681 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 872 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 532 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 912 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 2693 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 215 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 909 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 631 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 674 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 782 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 479 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 913 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 1051 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 1183 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 1093 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 693 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 648 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 771 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 813 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 1051 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 856 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 746 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 472 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 1205 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 752 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 790 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 757 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 585 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 732 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  34.75 
 
 		 650 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 878 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 406 aa  120  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 698 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 747 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  33.48 
 
 		 624 aa  119  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>