More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2907 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 492 aa  1002    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 892 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  48.07 
 
 		 1210 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 819 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 746 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 682 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  43.35 
 
 		 449 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  36.4 
 
 		 1182 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 704 aa  250  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 834 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 945 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 886 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.89 
 
 		 1248 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 936 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.27 
 
 		 754 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  38.04 
 
 		 676 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  40.13 
 
 		 657 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  51.09 
 
 		 1289 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  47.68 
 
 		 800 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  38.38 
 
 		 918 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1047 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.37 
 
 		 783 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 727 aa  220  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 991 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.05 
 
 		 744 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 1654 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 572 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 1093 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 		 964 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 1093 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 1676 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 980 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1714 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 551 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 767 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 3706 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 488 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 945 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 1239 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 932 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 771 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 1253 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 815 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 681 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 723 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 839 aa  167  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 1246 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 1177 aa  163  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 547 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 613 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.35 
 
 		 1663 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 631 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 1560 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 941 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 1051 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 913 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 732 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 909 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 437 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.33 
 
 		 2693 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.38 
 
 		 1668 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 1390 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 764 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 215 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 439 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 813 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 382 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 788 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 782 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 739 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 693 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 856 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 872 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 1183 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 749 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 545 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1051 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 878 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 746 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 732 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 1093 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 532 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 807 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 1205 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 657 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 757 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 912 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 747 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 752 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 648 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 771 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  35.41 
 
 		 650 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 774 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 626 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>