More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5074 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
479 aa  976    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
932 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
945 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
1093 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
1093 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
771 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
674 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
1183 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
913 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
912 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
790 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
788 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
1676 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
1051 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  31.12 
 
 
682 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.91 
 
 
744 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.67 
 
 
783 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
3706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
1253 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
815 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
1051 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
488 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
1654 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
613 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.45 
 
 
449 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.33 
 
 
892 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
964 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.63 
 
 
1182 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  27.44 
 
 
754 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
1390 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
657 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
681 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
2693 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
1560 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
839 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.24 
 
 
704 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
1714 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.25 
 
 
1210 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
732 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
1246 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
767 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
572 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
764 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.53 
 
 
819 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
215 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.61 
 
 
676 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  28.07 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  27.59 
 
 
657 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.61 
 
 
1668 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
878 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
727 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
991 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
1177 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  35.1 
 
 
746 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  35.27 
 
 
1248 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
941 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.14 
 
 
918 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.22 
 
 
886 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.77 
 
 
1239 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  35.92 
 
 
945 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
834 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.94 
 
 
1663 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
872 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
980 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
347 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
382 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
771 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
749 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
532 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
909 aa  123  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
524 aa  123  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
832 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
856 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
723 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
782 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  31.67 
 
 
1289 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  30 
 
 
800 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.92 
 
 
1047 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  31.44 
 
 
936 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
739 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  36.16 
 
 
624 aa  117  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
757 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
732 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
631 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.1 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
924 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
1093 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
381 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  31.05 
 
 
650 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
774 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
343 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>