More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2710 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  100 
 
 
744 aa  1549    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.4 
 
 
783 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
834 aa  280  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  63.13 
 
 
1239 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
1676 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 
1093 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
1093 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
727 aa  249  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
1654 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
3706 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.1 
 
 
1210 aa  238  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
932 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
1246 aa  233  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
547 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
815 aa  226  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
1390 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
681 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
1253 aa  221  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
945 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
572 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
764 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
1714 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 
964 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.93 
 
 
754 aa  213  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
551 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.24 
 
 
676 aa  211  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
526 aa  210  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 
1560 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
980 aa  207  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  28.59 
 
 
1051 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.54 
 
 
1182 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.4 
 
 
918 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  26.69 
 
 
892 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
488 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
788 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
767 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
771 aa  201  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
1177 aa  200  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.49 
 
 
819 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 
991 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  29.05 
 
 
492 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
872 aa  194  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  47.2 
 
 
1668 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  26.29 
 
 
886 aa  193  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  27.54 
 
 
746 aa  192  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
941 aa  191  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 
613 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
839 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
912 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  45.33 
 
 
1663 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
913 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
1227 aa  187  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.92 
 
 
1248 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  37 
 
 
524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
215 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.52 
 
 
682 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
2693 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
1051 aa  184  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
812 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
674 aa  180  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
602 aa  178  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.23 
 
 
449 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
924 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 
732 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
347 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
723 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  26.33 
 
 
945 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  35.43 
 
 
657 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
725 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
1183 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
382 aa  168  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
631 aa  168  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
532 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  29.26 
 
 
704 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
909 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
878 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
771 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
790 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.01 
 
 
1047 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
1255 aa  162  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
746 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  38.14 
 
 
800 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
782 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
472 aa  156  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
382 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.81 
 
 
802 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
585 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  35.71 
 
 
1289 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
479 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
832 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
752 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
657 aa  151  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
739 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
732 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
747 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  25.21 
 
 
936 aa  145  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
757 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>