More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3010 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
488 aa  991    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  54.14 
 
 
815 aa  349  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  47.62 
 
 
1239 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  44.36 
 
 
783 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 
1246 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
964 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
771 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
1654 aa  236  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
551 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
1093 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
1093 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
439 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
991 aa  229  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
572 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
526 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  37.03 
 
 
1210 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  39.29 
 
 
886 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
1390 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 
1714 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
932 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
681 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
3706 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
1676 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  39.08 
 
 
744 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 
1560 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.3 
 
 
754 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
524 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
788 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
1051 aa  203  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.83 
 
 
704 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
767 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
654 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  37.76 
 
 
819 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  35.85 
 
 
892 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
834 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  35.94 
 
 
682 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
1177 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  35.75 
 
 
449 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 
941 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  36.03 
 
 
1248 aa  193  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  35.8 
 
 
945 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 
732 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
462 aa  189  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
839 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
945 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  37.37 
 
 
918 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
2693 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 
723 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
727 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
382 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
613 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 
215 aa  183  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  37.1 
 
 
746 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
1253 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  37.25 
 
 
1182 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
764 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
878 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  43.96 
 
 
1668 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
674 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  34.33 
 
 
676 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  43 
 
 
1663 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
872 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
912 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
913 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
980 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
769 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  34.1 
 
 
657 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  36.41 
 
 
1047 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  42.98 
 
 
1289 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
909 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
773 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
1183 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  34.17 
 
 
492 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
347 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
773 aa  170  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
1227 aa  169  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
1051 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
670 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  39.46 
 
 
800 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  43.07 
 
 
649 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
535 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
790 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
472 aa  160  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  33.61 
 
 
936 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 
585 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
752 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
771 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
746 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  42.71 
 
 
824 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
924 aa  153  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
813 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.69 
 
 
431 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.19 
 
 
431 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
782 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  41.29 
 
 
381 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
856 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
381 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  37.92 
 
 
642 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>