More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1527 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1227 aa  2514    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
924 aa  259  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
3706 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
681 aa  209  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  28.11 
 
 
746 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 
1676 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
1390 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
1093 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
1093 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  28.24 
 
 
744 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.43 
 
 
783 aa  186  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
964 aa  184  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
815 aa  183  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
526 aa  182  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
1654 aa  181  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  35.6 
 
 
868 aa  180  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 
1267 aa  178  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.72 
 
 
1239 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 
780 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
551 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
947 aa  173  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
1714 aa  173  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 
962 aa  172  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
2072 aa  171  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 
903 aa  171  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
1253 aa  160  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
991 aa  159  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
613 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
980 aa  159  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
839 aa  157  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
488 aa  157  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
631 aa  156  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
1246 aa  157  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
347 aa  156  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
572 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
764 aa  154  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  25.48 
 
 
886 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
1177 aa  153  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
767 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
1050 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
941 aa  152  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
1399 aa  152  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
472 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  26.7 
 
 
1248 aa  149  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
657 aa  149  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
932 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
524 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
878 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
1051 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
547 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
2693 aa  145  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 
1758 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  32.2 
 
 
918 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
1055 aa  142  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
1560 aa  141  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
532 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
215 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.91 
 
 
754 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
834 aa  139  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
788 aa  138  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
732 aa  138  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
746 aa  138  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
931 aa  138  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1287 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
945 aa  137  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
1276 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.43 
 
 
1663 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
790 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
674 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
771 aa  135  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
696 aa  135  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.97 
 
 
1668 aa  135  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.15 
 
 
945 aa  134  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
872 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
1051 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  44.81 
 
 
525 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
780 aa  131  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
752 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
912 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  25.9 
 
 
676 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
771 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
747 aa  129  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  26.43 
 
 
1182 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
701 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
462 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  26.01 
 
 
1210 aa  128  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2786  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.49 
 
 
828 aa  128  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532868  normal  0.92327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
913 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
723 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  24.67 
 
 
936 aa  127  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
909 aa  126  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
585 aa  126  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
727 aa  125  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1068  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.93 
 
 
714 aa  125  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
732 aa  125  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  22.64 
 
 
892 aa  124  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1149  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.5 
 
 
730 aa  124  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1047 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
364 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  26.61 
 
 
682 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>