More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4851 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 		 746 aa  779    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 752 aa  1543    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 774 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 757 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 782 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 747 aa  343  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 749 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 732 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 739 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 771 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 856 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 832 aa  283  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 437 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 813 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 807 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 756 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 272 aa  190  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 771 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 1654 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 572 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 815 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 648 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  41.06 
 
 		 783 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 488 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 941 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 551 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.05 
 
 		 1663 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  41.55 
 
 		 744 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 439 aa  153  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.39 
 
 		 1668 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 964 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 2693 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 1177 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 991 aa  147  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1210 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 681 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 878 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 980 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1390 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 3706 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 1714 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 1560 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 945 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 532 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 693 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 1239 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 764 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 682 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 547 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 1205 aa  139  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  34.47 
 
 		 624 aa  139  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 732 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1182 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 1676 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 834 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 788 aa  137  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 1093 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1093 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 1093 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 723 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 347 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 657 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 704 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 361 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 613 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 1253 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  37.9 
 
 		 1289 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 1183 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 767 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 932 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 1246 aa  132  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 603 aa  132  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  36.05 
 
 		 754 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 674 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  34.68 
 
 		 918 aa  131  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 1227 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5852  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 300 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  37.37 
 
 		 650 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  36.57 
 
 		 449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 872 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 909 aa  128  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 362 aa  127  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 382 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 839 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 382 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 325 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 1051 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 362 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 381 aa  127  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 362 aa  126  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 524 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 631 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.94 
 
 		 381 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 364 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 360 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>