More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2234 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1676 aa  3471    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 3706 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 945 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  49.03 
 
 		 547 aa  367  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 1093 aa  350  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 1093 aa  349  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 1714 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 767 aa  342  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1820 aa  330  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 1654 aa  322  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 1390 aa  308  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 613 aa  301  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 2693 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1182 aa  292  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 1253 aa  273  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 551 aa  272  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 1560 aa  271  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1210 aa  266  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.07 
 
 		 744 aa  265  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 1246 aa  263  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  33.21 
 
 		 754 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1428 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.39 
 
 		 1501 aa  251  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.85 
 
 		 783 aa  249  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1289 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  54.22 
 
 		 732 aa  244  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 945 aa  244  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 771 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.15 
 
 		 918 aa  236  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 886 aa  234  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 819 aa  232  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 1051 aa  230  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  26.51 
 
 		 1248 aa  227  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 913 aa  227  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 572 aa  224  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 980 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 526 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 968 aa  220  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 892 aa  218  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 964 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 		 1791 aa  216  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.27 
 
 		 1239 aa  213  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 1177 aa  211  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 1516 aa  209  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 681 aa  209  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 932 aa  208  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  24.65 
 
 		 1561 aa  206  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 839 aa  205  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 488 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 1227 aa  201  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 933 aa  201  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 1418 aa  199  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 1669 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 1439 aa  197  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 688 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 746 aa  196  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 815 aa  196  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  29.41 
 
 		 676 aa  196  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 1965 aa  195  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.74 
 
 		 1079 aa  194  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 704 aa  193  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.26 
 
 		 1068 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  33.75 
 
 		 657 aa  192  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 941 aa  192  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 834 aa  192  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 		 1432 aa  192  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  32.03 
 
 		 1418 aa  191  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 912 aa  189  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  34 
 
 		 682 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.63 
 
 		 449 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 872 aa  187  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 439 aa  186  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 		 1297 aa  185  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 788 aa  185  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  21.81 
 
 		 1741 aa  184  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.7 
 
 		 1021 aa  183  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 727 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 1121 aa  182  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  30.32 
 
 		 1417 aa  182  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 1171 aa  182  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 1051 aa  181  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 844 aa  179  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 492 aa  178  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 1171 aa  178  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 1051 aa  178  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 991 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  30.33 
 
 		 754 aa  177  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 637 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.17 
 
 		 1404 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 1183 aa  176  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 790 aa  175  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 1111 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 1596 aa  174  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 658 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 764 aa  172  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 		 1344 aa  171  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 723 aa  170  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 936 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 524 aa  169  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 986 aa  169  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>