More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2552 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 819 aa  1666    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  45.84 
 
 		 1210 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 892 aa  445  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 746 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1182 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.19 
 
 		 1248 aa  353  8e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 936 aa  333  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 945 aa  331  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  56.9 
 
 		 657 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 886 aa  327  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  42.04 
 
 		 676 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 682 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  43 
 
 		 449 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  61.94 
 
 		 800 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  37.5 
 
 		 754 aa  292  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  63.36 
 
 		 1289 aa  287  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 704 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 1047 aa  278  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  52.65 
 
 		 918 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1093 aa  257  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 1093 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 1676 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 834 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.72 
 
 		 783 aa  219  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 1654 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 727 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 3706 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 1246 aa  212  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1714 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 980 aa  206  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  28.49 
 
 		 744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 488 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 		 991 aa  194  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 932 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 964 aa  184  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 1239 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 1390 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 771 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 572 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 767 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 839 aa  172  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 1253 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 764 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 1177 aa  168  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 1051 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 1051 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 462 aa  164  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 815 aa  163  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 945 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 723 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 613 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 215 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.71 
 
 		 1663 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 		 1501 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.34 
 
 		 1668 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 551 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 913 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 347 aa  147  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 2693 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1560 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 681 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 912 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 790 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1183 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.42 
 
 		 1423 aa  140  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 941 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 1002 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0364  PAS sensor protein  28.38 
 
 		 501 aa  137  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 1178 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 535 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 732 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  26.34 
 
 		 1041 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 674 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 878 aa  134  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 439 aa  134  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 872 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 1016 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 472 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 532 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 909 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 782 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 739 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 813 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 1001 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.51 
 
 		 878 aa  127  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 526 aa  127  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.88 
 
 		 833 aa  127  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 693 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 1418 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 771 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 1363 aa  125  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 382 aa  125  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.84 
 
 		 1071 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 841 aa  124  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 479 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.473035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>