More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1483 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  62.82 
 
 		 1182 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 704 aa  1457    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  37.26 
 
 		 676 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  46.26 
 
 		 918 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  46.2 
 
 		 754 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  52.56 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 682 aa  290  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 819 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1210 aa  277  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 892 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  42.9 
 
 		 1019 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 746 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 886 aa  263  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  41.6 
 
 		 1289 aa  257  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  46.01 
 
 		 449 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  35.66 
 
 		 800 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 936 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 945 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  39.19 
 
 		 1248 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 1047 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  31.81 
 
 		 1202 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 547 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 727 aa  218  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 834 aa  205  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 551 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 783 aa  203  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 991 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 488 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 964 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 1714 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1676 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 717 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 788 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 771 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 1246 aa  188  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 1093 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 1093 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 789 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 815 aa  181  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 1390 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 462 aa  177  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 1654 aa  177  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.94 
 
 		 683 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 913 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 3706 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.96 
 
 		 828 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 1239 aa  170  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 932 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.88 
 
 		 960 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 1131 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 839 aa  168  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 526 aa  168  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.26 
 
 		 744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 945 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1059 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  49.03 
 
 		 1081 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 1253 aa  164  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.55 
 
 		 922 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 681 aa  161  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 1177 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1051 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 979 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 732 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 215 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 1015 aa  154  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1011 aa  153  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 980 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 767 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.25 
 
 		 1663 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 872 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.4 
 
 		 1668 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 912 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 1560 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 		 489 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  30.95 
 
 		 1561 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 941 aa  147  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 723 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 1051 aa  143  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 524 aa  144  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 631 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 1183 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 896 aa  141  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  48.59 
 
 		 914 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 382 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 532 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 878 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 1020 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 674 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 782 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 746 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1714  putative PAS/PAC sensor protein  35.43 
 
 		 920 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.183434  normal  0.382108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3536  putative sensory transduction histidine kinase  46.98 
 
 		 161 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0560358  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.09 
 
 		 696 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0252232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 771 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 752 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 856 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>