More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0299 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  100 
 
 
1239 aa  2561    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  60 
 
 
1274 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  49.69 
 
 
815 aa  311  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
488 aa  303  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
832 aa  303  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
1246 aa  290  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  63.13 
 
 
744 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  67.34 
 
 
1255 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0818  EAL and GGDEF domain-containing protein  58.53 
 
 
976 aa  253  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.48 
 
 
758 aa  251  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
572 aa  233  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1654 aa  227  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
771 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
3706 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
1177 aa  221  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
1093 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
1093 aa  218  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  35.05 
 
 
1112 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
964 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  39.95 
 
 
783 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
1390 aa  215  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
551 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1676 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
991 aa  213  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
839 aa  212  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  32.97 
 
 
852 aa  212  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.73 
 
 
669 aa  211  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  32.33 
 
 
945 aa  208  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1079 aa  208  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
834 aa  207  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  35.16 
 
 
886 aa  207  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  33.76 
 
 
1248 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
913 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
1253 aa  203  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
681 aa  202  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
1051 aa  201  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
1225 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.07 
 
 
754 aa  195  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  47.09 
 
 
1560 aa  194  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.77 
 
 
1096 aa  194  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.09 
 
 
676 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
526 aa  190  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
613 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
767 aa  190  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
547 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
1279 aa  188  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 
1124 aa  187  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
932 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
813 aa  186  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 
1322 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
2072 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.86 
 
 
892 aa  183  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
764 aa  184  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.05 
 
 
1182 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
912 aa  182  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
1051 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
834 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  30.63 
 
 
819 aa  181  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.97 
 
 
1210 aa  181  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
945 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
1714 aa  181  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
439 aa  180  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  38.11 
 
 
918 aa  179  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
462 aa  178  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.19 
 
 
746 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
788 aa  177  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
790 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
1227 aa  176  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
980 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  25.28 
 
 
800 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  34.45 
 
 
1047 aa  173  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
215 aa  173  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
732 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
2693 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 
723 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
941 aa  172  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
872 aa  172  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
631 aa  171  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  28.83 
 
 
830 aa  171  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.78 
 
 
704 aa  170  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
674 aa  170  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  30.79 
 
 
936 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
524 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.56 
 
 
492 aa  166  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
924 aa  166  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
382 aa  164  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  41.67 
 
 
1663 aa  164  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.05 
 
 
802 aa  164  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.8 
 
 
449 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.86 
 
 
1668 aa  163  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
532 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
727 aa  161  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
832 aa  161  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
771 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.26 
 
 
657 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
657 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
878 aa  159  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
585 aa  158  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
347 aa  157  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1394  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
786 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.462378  normal  0.162858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>