More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1487 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 924 aa  1912    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 781 aa  300  9e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1227 aa  259  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 1093 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 1093 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 1267 aa  178  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  40.09 
 
 		 744 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 3706 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 1714 aa  168  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 1676 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 909 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 1390 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  37.82 
 
 		 1239 aa  166  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.25 
 
 		 903 aa  164  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.46 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 681 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 1246 aa  162  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 613 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 964 aa  160  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 1654 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1399 aa  158  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  26.21 
 
 		 1248 aa  157  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 886 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 815 aa  155  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 1177 aa  153  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 488 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 941 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  24.16 
 
 		 1561 aa  148  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 572 aa  148  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  22.2 
 
 		 1205 aa  148  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1182 aa  148  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 526 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 991 aa  147  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 1253 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 788 aa  147  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 		 2072 aa  144  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 1055 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 2693 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 532 aa  141  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 932 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 347 aa  138  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 472 aa  138  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1051 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 980 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 771 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.63 
 
 		 1668 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 215 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 767 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 732 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 1560 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1149  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.08 
 
 		 730 aa  132  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 913 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  27.02 
 
 		 918 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  45.45 
 
 		 525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 747 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.68 
 
 		 1663 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 834 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 945 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 912 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 657 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 551 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 		 1758 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 839 aa  125  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 674 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 1051 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 547 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1068  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.1 
 
 		 714 aa  124  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  39.89 
 
 		 474 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 790 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 1276 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 945 aa  121  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 819 aa  121  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  25.23 
 
 		 754 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2688  putative PAS/PAC sensor protein  29.84 
 
 		 937 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.139133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 910 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 631 aa  119  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 723 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 698 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 872 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 746 aa  118  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 524 aa  118  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 878 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1308  hypothetical protein  36.81 
 
 		 792 aa  117  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  28.85 
 
 		 387 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1311  hypothetical protein  42.55 
 
 		 792 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0329  hypothetical protein  34.86 
 
 		 740 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 1047 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  25.29 
 
 		 676 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0352  hypothetical protein  27.45 
 
 		 507 aa  114  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 771 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 382 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.46 
 
 		 1207 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  33.19 
 
 		 657 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1210 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 503 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  26.39 
 
 		 965 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>