More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5451 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
547 aa  1125    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.1 
 
 
695 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  50.26 
 
 
945 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  49.03 
 
 
1676 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
708 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
767 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  44.35 
 
 
663 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 
882 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.61 
 
 
668 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.61 
 
 
668 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
545 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 
1560 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  35.61 
 
 
1182 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  36.59 
 
 
754 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  35.82 
 
 
918 aa  248  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  51.53 
 
 
732 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
788 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
3706 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  42.55 
 
 
744 aa  233  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  33.86 
 
 
657 aa  229  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  32.28 
 
 
704 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
551 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  55.96 
 
 
468 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
613 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
2693 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  37.29 
 
 
783 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
681 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
1051 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
1390 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 
964 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
1093 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
1093 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 
1177 aa  203  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
771 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
572 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 
488 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  33.85 
 
 
1210 aa  194  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
1654 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
834 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.69 
 
 
1808 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.36 
 
 
1239 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.12 
 
 
676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 
941 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
932 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.3 
 
 
682 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 
815 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
1253 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
1714 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  31.3 
 
 
892 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
991 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
723 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.3 
 
 
1047 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
913 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  32.21 
 
 
449 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
839 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
727 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
1051 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  34.31 
 
 
819 aa  166  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  32.43 
 
 
886 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  31.22 
 
 
746 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
865 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.96 
 
 
1248 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.91 
 
 
945 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
790 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1650  sensory box protein  31.91 
 
 
819 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00487383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
872 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
524 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
912 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
215 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
347 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
980 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
462 aa  160  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  42.79 
 
 
1289 aa  160  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
1246 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.1 
 
 
1668 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  35.35 
 
 
800 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
909 aa  157  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  33.94 
 
 
492 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
674 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
764 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.37 
 
 
520 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
1183 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
479 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
746 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
382 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
498 aa  150  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.65 
 
 
1663 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
532 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.65 
 
 
532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
1501 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
878 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4169  ATPase domain-containing protein  54.33 
 
 
435 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0180001  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
1227 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4538  histidine kinase  54.33 
 
 
417 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
1432 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
1344 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4682  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.76 
 
 
424 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>