More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3447 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  100 
 
 
1210 aa  2469    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  45.84 
 
 
819 aa  572  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  47.5 
 
 
892 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  47.25 
 
 
492 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  42.4 
 
 
746 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  51.52 
 
 
682 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  32.2 
 
 
1182 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.42 
 
 
945 aa  336  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  32.18 
 
 
1248 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  44.32 
 
 
449 aa  295  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
1246 aa  294  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  37.08 
 
 
754 aa  293  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
1714 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  45.99 
 
 
676 aa  280  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
1654 aa  279  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  31.3 
 
 
886 aa  278  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.76 
 
 
704 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
3706 aa  275  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
1676 aa  266  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  36.9 
 
 
918 aa  258  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  32.44 
 
 
936 aa  251  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 
834 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 
1093 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.35 
 
 
783 aa  244  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
1093 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  54.26 
 
 
800 aa  240  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  47.84 
 
 
657 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  34.52 
 
 
1047 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.1 
 
 
744 aa  238  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
1390 aa  234  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 
727 aa  225  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  50.6 
 
 
1289 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
771 aa  225  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
1253 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
488 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
572 aa  214  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
964 aa  209  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 
991 aa  207  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
980 aa  206  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
681 aa  206  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
767 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
1177 aa  202  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
547 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
932 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
839 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
551 aa  189  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
631 aa  182  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.97 
 
 
1239 aa  180  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
815 aa  180  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 
1791 aa  179  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
462 aa  179  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
723 aa  179  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
1501 aa  178  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.61 
 
 
1927 aa  177  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
613 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
732 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
1560 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
941 aa  172  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
788 aa  171  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
945 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
1051 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  41.59 
 
 
1663 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
1002 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
764 aa  162  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
1051 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.25 
 
 
1668 aa  162  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 
1016 aa  160  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
439 aa  160  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
872 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 
1432 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  23.9 
 
 
1041 aa  159  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
912 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.61 
 
 
878 aa  157  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
215 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1001 aa  157  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
347 aa  156  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
526 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
2693 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
1009 aa  155  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
909 aa  155  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 
2654 aa  154  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
1273 aa  154  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  23.7 
 
 
1561 aa  154  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
913 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
897 aa  153  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.14 
 
 
1342 aa  152  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0364  PAS sensor protein  31.07 
 
 
501 aa  148  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140778  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  24.54 
 
 
917 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  27.29 
 
 
872 aa  148  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
878 aa  147  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
752 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
1093 aa  145  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 
1138 aa  144  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
524 aa  144  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
1418 aa  144  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
437 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
1741 aa  143  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
1808 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
382 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
929 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>