More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1496 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1253 aa  2570    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  45.27 
 
 		 812 aa  425  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 1032 aa  347  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 912 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 1050 aa  294  7e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 1177 aa  293  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.55 
 
 		 783 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 1390 aa  280  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 1676 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 1093 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 1093 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 681 aa  243  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 1246 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1262 aa  238  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1182 aa  235  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1051 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.65 
 
 		 1258 aa  231  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 771 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  33.49 
 
 		 1258 aa  223  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1210 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.47 
 
 		 744 aa  221  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.9 
 
 		 1248 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 980 aa  220  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.78 
 
 		 783 aa  219  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 964 aa  218  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 3706 aa  218  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1289 aa  208  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.06 
 
 		 1239 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 913 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 991 aa  201  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 551 aa  199  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 1654 aa  198  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 839 aa  197  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 945 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 746 aa  197  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 572 aa  196  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  32.45 
 
 		 713 aa  194  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 892 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1047 aa  192  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 347 aa  191  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 613 aa  191  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1714 aa  189  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 815 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 878 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 		 631 aa  185  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 872 aa  184  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 932 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  32.18 
 
 		 676 aa  182  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 439 aa  181  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 547 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 1560 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 788 aa  181  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  37.9 
 
 		 754 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  41.67 
 
 		 449 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 1171 aa  179  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 488 aa  179  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 945 aa  178  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 1051 aa  178  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 936 aa  178  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 886 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 767 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 2693 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.72 
 
 		 1668 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.39 
 
 		 918 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 215 aa  172  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 674 aa  172  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 637 aa  171  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  42.62 
 
 		 657 aa  170  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  27.46 
 
 		 965 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 819 aa  168  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  43.22 
 
 		 1663 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 705 aa  168  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 732 aa  168  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 834 aa  167  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 790 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 532 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 844 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 1093 aa  164  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 524 aa  164  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 704 aa  164  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 657 aa  164  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 462 aa  163  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 1183 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 682 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 492 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.16 
 
 		 853 aa  162  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  43.41 
 
 		 718 aa  162  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 526 aa  162  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  40.69 
 
 		 632 aa  161  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 1227 aa  161  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.03 
 
 		 1195 aa  161  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.88 
 
 		 853 aa  161  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000400428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  32.66 
 
 		 754 aa  160  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  39.83 
 
 		 638 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  40.87 
 
 		 632 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 382 aa  160  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 1171 aa  159  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 1301 aa  158  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.69 
 
 		 657 aa  157  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>