More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3247 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 746 aa  1518    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 819 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  42.4 
 
 		 1210 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 892 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 492 aa  326  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 886 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 936 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1182 aa  312  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  40.3 
 
 		 1248 aa  306  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  46.36 
 
 		 676 aa  291  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  37.64 
 
 		 800 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 945 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  37.24 
 
 		 754 aa  276  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  40.83 
 
 		 657 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1047 aa  274  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 704 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  55.65 
 
 		 1289 aa  264  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 964 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  36.3 
 
 		 918 aa  251  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 3706 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  48.41 
 
 		 449 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.26 
 
 		 783 aa  220  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 1714 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 682 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 909 aa  208  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 1246 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 1227 aa  205  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 681 aa  201  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 767 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 1253 aa  197  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1676 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 631 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 1390 aa  195  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 834 aa  194  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.54 
 
 		 744 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 764 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 991 aa  191  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 1654 aa  191  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 727 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 1093 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 1093 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 1177 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 771 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 839 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 613 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 1239 aa  177  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 980 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 634 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 488 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.37 
 
 		 754 aa  170  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 462 aa  167  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 874 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 932 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 912 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1928  two component LuxR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 815 aa  160  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 1051 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.35 
 
 		 1668 aa  157  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 945 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 1050 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 913 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 		 1193 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.6 
 
 		 1663 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 347 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 		 1559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1171 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 759 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 1191 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1183 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 773 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 732 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 790 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 1171 aa  146  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 720 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 215 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 524 aa  144  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 603 aa  143  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1055 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 647 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 878 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 769 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 674 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 832 aa  140  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.5 
 
 		 1404 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 645 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 1560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 		 907 aa  138  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 936 aa  138  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 		 637 aa  138  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 630 aa  138  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  48.92 
 
 		 2468 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 645 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 1085 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>