More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1008 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 347 aa  707    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 1390 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 572 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 991 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 		 1714 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 1253 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  42.73 
 
 		 783 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 964 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 		 2693 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 941 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 681 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 215 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 1654 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 1093 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 1093 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 3706 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 815 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  38.64 
 
 		 744 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 1177 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 674 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 732 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  35.89 
 
 		 754 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 932 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 834 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 788 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 1560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 532 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 771 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 682 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 		 723 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  40.89 
 
 		 918 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 856 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 767 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  38.49 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 945 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 909 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 1676 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 1051 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 872 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 1246 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 980 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  37.74 
 
 		 1239 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 727 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 1227 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  38.43 
 
 		 1210 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 886 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 631 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1182 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 878 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 839 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  40.74 
 
 		 657 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.73 
 
 		 1668 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  38.72 
 
 		 676 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 764 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  39.74 
 
 		 1248 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 945 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  40.25 
 
 		 1289 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 551 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 613 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.75 
 
 		 1663 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 913 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 746 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 462 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 1047 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 524 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 819 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 892 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 790 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 472 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 732 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  38.2 
 
 		 800 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 771 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 746 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 1183 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 657 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 648 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 1205 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 912 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 924 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 936 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 749 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 747 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  37.96 
 
 		 650 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 752 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 1051 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 756 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 414 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  35.32 
 
 		 624 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 693 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 813 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 704 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>