More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1359 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 631 aa  1308    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 524 aa  326  6e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 1246 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 3706 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 746 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 681 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 1177 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 		 1253 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1210 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 764 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 892 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 886 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 767 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 1239 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 1093 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1182 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 1093 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  26.95 
 
 		 744 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1676 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 819 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 1390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 1654 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 551 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1289 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 1714 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 839 aa  160  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  27.98 
 
 		 1248 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 572 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 980 aa  158  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 1227 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.5 
 
 		 754 aa  157  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  27.79 
 
 		 800 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 964 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 347 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 941 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 1047 aa  153  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  27.31 
 
 		 918 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 991 aa  153  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.27 
 
 		 783 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  44.27 
 
 		 821 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 872 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.95 
 
 		 1668 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.93 
 
 		 1663 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 439 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 788 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.7 
 
 		 449 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 771 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 704 aa  143  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 613 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 1560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 945 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 215 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 936 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 749 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 488 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 909 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.58 
 
 		 676 aa  137  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 815 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 945 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 739 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  33.78 
 
 		 657 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 723 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  35.51 
 
 		 650 aa  134  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 913 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 1205 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 532 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 932 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 746 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 1051 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 2693 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 1051 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 912 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 813 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 774 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 752 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 657 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 732 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1093 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 674 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 682 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 782 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 732 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 545 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 790 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 771 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 924 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 832 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 834 aa  117  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 856 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 984 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>