More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3911 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1093 aa  2259    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.2 
 
 		 1105 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  24.53 
 
 		 1407 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.75 
 
 		 1114 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  24.04 
 
 		 1024 aa  218  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.64 
 
 		 1070 aa  218  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  23.12 
 
 		 1054 aa  215  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.95 
 
 		 1093 aa  211  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  22.74 
 
 		 1526 aa  208  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24.32 
 
 		 1370 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  23.07 
 
 		 1070 aa  207  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  23.66 
 
 		 1034 aa  202  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.91 
 
 		 1397 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.22 
 
 		 1086 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.06 
 
 		 1258 aa  194  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  22.9 
 
 		 1355 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  22.84 
 
 		 1373 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  22.85 
 
 		 1005 aa  187  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.34 
 
 		 1351 aa  186  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  23.28 
 
 		 1374 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  22.53 
 
 		 1324 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  23.83 
 
 		 1306 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  21.94 
 
 		 1388 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  24.13 
 
 		 1278 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  22.15 
 
 		 1093 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  22.82 
 
 		 1327 aa  174  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  22.28 
 
 		 1400 aa  173  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  22.36 
 
 		 1384 aa  171  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  21.83 
 
 		 1347 aa  169  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  20.89 
 
 		 1316 aa  168  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  23.15 
 
 		 1063 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  22.24 
 
 		 1378 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  21.8 
 
 		 1378 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  21.97 
 
 		 1363 aa  164  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 1253 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  21.62 
 
 		 1017 aa  161  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  23.58 
 
 		 1053 aa  159  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 941 aa  158  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  23.99 
 
 		 1335 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 774 aa  156  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 681 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 771 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 1654 aa  154  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 1093 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 648 aa  153  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  37.96 
 
 		 624 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 1093 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 1714 aa  151  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.38 
 
 		 1334 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 815 aa  148  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 782 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 439 aa  147  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 832 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 693 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  22.08 
 
 		 1118 aa  145  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.08 
 
 		 1342 aa  145  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  37.61 
 
 		 1210 aa  144  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 698 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 1390 aa  144  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  40.59 
 
 		 754 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 991 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 739 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 1047 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  22.89 
 
 		 1311 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.19 
 
 		 1079 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  20.31 
 
 		 1046 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 807 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 3706 aa  141  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.77 
 
 		 1668 aa  141  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  40.09 
 
 		 1182 aa  141  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  38.1 
 
 		 744 aa  141  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 834 aa  141  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  23.35 
 
 		 1414 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 856 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 488 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  39.45 
 
 		 1248 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 2693 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 878 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 572 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 945 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  22.44 
 
 		 1278 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 746 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 752 aa  139  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 382 aa  139  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1560 aa  139  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 964 aa  139  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  41.09 
 
 		 918 aa  138  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 215 aa  138  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.96 
 
 		 1373 aa  138  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 757 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  34.09 
 
 		 449 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.19 
 
 		 783 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.87 
 
 		 1663 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 682 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  38.1 
 
 		 676 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 886 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 472 aa  137  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 532 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 872 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  21.37 
 
 		 1250 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>